Gen

Innehållsförteckning:

Gen
Gen
Anonim

Inmatningsnavigering

  • Inmatningsinnehåll
  • Bibliografi
  • Akademiska verktyg
  • Vänner PDF-förhandsvisning
  • Författare och Citation Info
  • Tillbaka till toppen

Gen

Först publicerad tis 26 oktober 2004; substantiell revidering tors 19 februari 2015

”Det kan finnas lite tvivel,” hävdade filosofen och biokemisten Lenny Moss 2003,”att idén om” genen”har varit det centrala organiserande temat för det tjugonde århundradets biologi” (Moss 2003, xiii; jfr. Keller 2000, 9). Och ändå är det tydligt att genetikvetenskapen aldrig tillhandahöll en allmänt accepterad definition av genen. Mer än hundra års genetisk forskning har snarare resulterat i spridning av olika genkoncept, som ibland kompletterar, ibland motsäger varandra. Vissa filosofer och forskare har försökt att avhjälpa denna situation genom att minska denna mängd genbegrepp, antingen "vertikalt" till en grundläggande enhet, eller "horisontellt" genom att subventionera dem under en allmän term. Andra har valt fler pluralistiska ståndpunkter. Som en konsekvens,”Genen” har blivit ett hett ämne i vetenskapsfilosofin kring vilka frågor om reduktion, uppkomst eller övervakning av begrepp och teorier (tillsammans med de epistemiska enheter som de hänvisar till) livligt diskuteras. Hittills har dock alla försök att uppnå enighet om dessa frågor varit framgångsrika. I dag, sedan avslutandet av den mänskliga genomsekvensen och början på det som kallas postgenomics era, upplever genetik igen en tid med konceptuell förändring. Genbegreppet, som kommer ut ur ett sekel av genetisk forskning, har varit och fortsätter att vara, som Raphael Falk påminde oss för inte så länge sedan, ett "begrepp i spänning" (Falk 2000).alla försök att uppnå enighet om dessa frågor har inte lyckats. I dag, sedan avslutandet av den mänskliga genomsekvensen och början på det som kallas postgenomics era, upplever genetik igen en tid med konceptuell förändring. Genbegreppet, som kommer ut ur ett sekel av genetisk forskning, har varit och fortsätter att vara, som Raphael Falk påminde oss för inte så länge sedan, ett "begrepp i spänning" (Falk 2000).alla försök att uppnå enighet om dessa frågor har inte lyckats. I dag, sedan avslutandet av den mänskliga genomsekvensen och början på det som kallas postgenomikens era, upplever genetik igen en tid med konceptuell förändring. Genbegreppet, som kommer ut ur ett sekel av genetisk forskning, har varit och fortsätter att vara, som Raphael Falk påminde oss för inte så länge sedan, ett "begrepp i spänning" (Falk 2000).som Raphael Falk påminde oss för inte så länge sedan, ett "spänningsbegrepp" (Falk 2000).som Raphael Falk påminde oss för inte så länge sedan, ett "spänningsbegrepp" (Falk 2000).

Layouten för följande artikel kommer därför att vara i stort sett historisk. Det finns flera berättelser om den historiska utvecklingen och diversifieringen av genbegreppet, skriven ur perspektivet av en idéhistoria (Dunn 1965; Stubbe 1965; Carlson 1966, 2004; Schwartz 2008). Medan vi till stor del kommer att följa den konventionella tidslinjen för händelser som fastställts i denna litteratur, kommer vi att ta ett något annat perspektiv genom att titta på gener som epistemiska objekt, dvs som objekt som utsätts för pågående forskning. Detta innebär att vi inte bara kommer att relatera etablerade begrepp för "genen", utan snarare analysera hur förändrade experimentella metoder och experimentella system bestämde och modifierade sådana begrepp (se även posten om experiment i biologi). Efter att sålunda ha etablerat ett rikt historiskt "panorama" av genen som ett "begrepp i flöde",För att ta upp en suggestiv term som introducerats av Yehuda Elkana (1970; jfr. Falk 1986) kommer några mer allmänna filosofiska teman att behandlas kort, för vilken genen har fungerat som ett bekvämt "handtag" i diskussionen. Dessa kretsar kring ämnet reduktion, men involverar också frågor om kausalitet i levande system (för mer detaljerade redogörelser se poster om molekylärbiologi, molekylär genetik, biologisk information och reduktionism i biologi; för en nyligen behandlad monografilängd av filosofiska frågor om genetik, se Griffiths och Stotz 2013).men involverar också frågor om kausalitet i levande system (för mer detaljerade redogörelser se poster om molekylärbiologi, molekylär genetik, biologisk information och reduktion inom biologi; för en nyligen behandlad monografilängd av filosofiska frågor om genetik, se Griffiths och Stotz 2013).men involverar också frågor om kausalitet i levande system (för mer detaljerade redogörelser se poster om molekylärbiologi, molekylär genetik, biologisk information och reduktion inom biologi; för en nyligen behandlad monografilängd av filosofiska frågor om genetik, se Griffiths och Stotz 2013).

  • 1. Förhistorien om genen
  • 2. Genen i klassisk genetik
  • 3. Genen i molekylär genetik
  • 4. Genen i utveckling och utveckling
  • 5. Frågan om minskning
  • Bibliografi
  • Akademiska verktyg
  • Andra internetresurser
  • Relaterade poster

1. Förhistorien om genen

Innan vi behandlar de historiska stadierna i genkonceptets trassliga utveckling måste vi se hur det kom till. Det var först på 1800-talet som ärftlighet blev ett stort problem att hantera i biologin (López Beltrán 2004; Müller-Wille och Rheinberger 2007 och 2012). Med ökningen av ärftlighet som biologiskt forskningsområde tog frågan om dess materiella grund och dess mekanism form. Under andra hälften av 1800-talet föreslogs två alternativa ramverk för att hantera denna fråga. Den första tänkte på ärftlighet som en kraft vars styrka samlades under generationerna och som som en mätbar storlek kunde underkastas statistisk analys. Detta begrepp var särskilt utbredd bland uppfödare från 1800-talet (Gayon och Zallen 1998) och påverkade Francis Galton och den så kallade”biometriska skolan” (Gayon 1998, 105-146). Det andra ramverket såg ärftlighet som bosatt i materia som överfördes från en generation till nästa. Två stora trender ska differentieras här. En av dem betraktade ärftliga ämnen som partiklar och mottagliga för avelsanalys. Charles Darwin kallade till exempel de förmodade ärftliga partiklarna "gemmules"; Hugo de Vries,”pangenes”. Ingen av dessa nittonhundratalets författare tänkte emellertid att associera dessa partiklar med ett särskilt ärftligt ämne. De trodde alla att de bestod av samma saker som resten av organismen var gjord av, så att deras bara tillväxt,rekombination och ansamling i massa skulle synliggöra de speciella drag som de var ansvariga för. En andra kategori av biologer under andra hälften av nittonhundratalet, till vilka Carl Naegeli och August Weismann tillhörde, skilde kroppssubstansen, "trofoplasma" eller "soma", från ett specifikt ärftligt ämne, "idioplasmen" eller "bakterien plasm”, som antogs vara ansvarig för den arvliga kontinuiteten mellan generationerna. Men de tog denna idioplasmiska substans som vara, inte partikelformig, men mycket organiserad. I fallet med Weismann förblev det intakt i groddcellerna, men oåterkalleligt differentierat i kroppens celler under utvecklingen. När det gäller Naegeli sträckte sig det även från cell till cell och genom hela kroppen, ett kapillärt ärftligt system som är analogt med nervsystemet (Robinson 1979;Churchill 1987, Rheinberger 2008).

Mendel sticker ut bland dessa biologer, även om han arbetade inom en väldefinierad botanisk tradition av hybridforskning. Han betraktas generellt som föregångaren till det tjugonde århundradets genetik (se emellertid Olby 1979 och, för en nyare diskussion, Orel och Hartl 1997). Som Jean Gayon har hävdat, attackerade Mendels papper från 1865 arv från en helt ny vinkel, och tolkade den inte som en mätbar storlek, som den biometriska skolan gjorde i ett senare skede, men som "en viss organisationsnivå", en "struktur i en den givna generationen ska uttryckas i samband med specifika kors. " Det är därför Mendel använde en "beräkning av skillnader", dvs kombinatorisk matematik för upplösning av ärftliga fenomen (Gayon 2000, 77-78). Med det,han introducerade ett nytt formellt verktyg för en analys av hybridiseringsexperiment som samtidigt baserades på en ny experimentell regim: valet av par av alternativa och "konstant" (dvs. ärftliga) egenskaper. Mendel trodde att dessa egenskaper var relaterade av en "konstant utvecklingslag" till vissa "element" eller "faktorer" i de reproduktionsceller som organismer utvecklades från. En analys av fördelningen av alternativa egenskaper i avkommor av hybrider kan därför avslöja något om förhållandet som de underliggande "faktorerna" uppstod när de förenades i den hybridföräldraorganismen (Müller-Wille och Orel 2007). Mendel trodde att dessa egenskaper var relaterade av en "konstant utvecklingslag" till vissa "element" eller "faktorer" i de reproduktionsceller som organismer utvecklades från. En analys av fördelningen av alternativa egenskaper i avkommor av hybrider kan därför avslöja något om förhållandet som de underliggande "faktorerna" uppstod när de förenades i den hybridföräldraorganismen (Müller-Wille och Orel 2007). Mendel trodde att dessa egenskaper var relaterade av en "konstant utvecklingslag" till vissa "element" eller "faktorer" i de reproduktionsceller som organismer utvecklades från. En analys av fördelningen av alternativa egenskaper i avkommor av hybrider kan därför avslöja något om förhållandet som de underliggande "faktorerna" uppstod när de förenades i den hybridföräldraorganismen (Müller-Wille och Orel 2007).

2. Genen i klassisk genetik

Året 1900 kan ses som annus mirabilis som födde en ny disciplin som snart skulle kallas genetik. Under det året rapporterade tre botanister, Hugo de Vries, Carl Correns och Erich Tschermak, om deras avelsförsök i slutet av 1890-talet och hävdade ha bekräftat regelbundenheten i överföringen av karaktärer från föräldrar till avkommor som Mendel redan hade presenterat i hans seminalpapper 1865 (Olby 1985, 109-37). I deras experimentella kors med Zea mays, Pisum och Phaseolus observerade de i princip att de element som ansvarar för par av alternativa drag,”allelomorphs” i den senare terminologin av William Bateson (1902), som snart kom till allmän användning under förkortningen av”alleler” segregerade slumpmässigt i den andra filialgenerationen (Mendels lag om segregering),och att dessa element överfördes oberoende av varandra (Mendels lag om oberoende sortiment). Den ytterligare observationen att ibland flera element uppträdde som om de var länkade, bidrog till antagandet att Walter Sutton och Theodor Boveri snart antog att dessa element var belägna i grupper på olika kromosomer i kärnan. Således antog kromosomteorin om arv att regelbundenheten för karaktäröverföring grundades i cytomorfologi, särskilt kärnmorfologin med dess individuella kromosomer som bibehåller sin identitet genom generationerna (Coleman 1965; Martins 1999).bidragit till antagandet som snart framhölls av Walter Sutton och av Theodor Boveri att dessa element var belägna i grupper på olika kromosomer i kärnan. Således antog kromosomteorin om arv att regelbundenheten för karaktäröverföring grundades i cytomorfologi, särskilt kärnmorfologin med dess individuella kromosomer som bibehåller sin identitet genom generationerna (Coleman 1965; Martins 1999).bidragit till antagandet som snart framhölls av Walter Sutton och av Theodor Boveri att dessa element var belägna i grupper på olika kromosomer i kärnan. Således antog kromosomteorin om arv att regelbundenheten för karaktäröverföring grundades i cytomorfologi, särskilt kärnmorfologin med dess individuella kromosomer som bibehåller sin identitet genom generationerna (Coleman 1965; Martins 1999).

Trots initialt motstånd från den biometriska skolan (Provine 1971; Mackenzie och Barnes 1979) växte medvetenheten snabbt om att möjligheten till ett oberoende sortiment av diskreta ärftliga faktorer enligt sannolikhetslagarna skulle ses som själva hörnstenen i ett nytt "paradigm"”Av arv (Kim 1994). Detta gick samman efter en inledande period av konflikt av vad Elof Carlson kallade”enhets-karaktärsförfalskning” (Carlson 1966, kap. 4) med upprättandet av en kategorisk distinktion mellan genetiska faktorer å ena sidan och egenskaper eller karaktärer å andra sidan hand. Maskeringseffekten av dominerande drag jämfört med recessiva och den efterföljande återkomsten av recessiva drag var särskilt instrument för att stabilisera denna distinktion (Falk 2001). Dessutom resonerade det med det tidigare konceptet med två materiella regimer,en germinal och en kroppslig, redan befordrad av Naegeli och Weismann.

Ändå om - som Correns uttalade i sin första recension om den nya Mendelian-litteraturen 1901 -”vi kan inte upprätthålla idén om en permanent fixering [av de ärftliga faktorerna] i groddplasm, men måste anta, på grund av deras blandbarhet, några mobilitet åtminstone vid vissa tidpunkter,”och om kromosomalkoppling var en möjlig, men inte en nödvändig och allmän mekanism för att överföra struktur till arv, hur var det för att förklara den successiva och regelbundna fysiologiska implementeringen av dispositionerna (Anlagen) i den ordnade utvecklingen av organismen? För att lösa denna svårighet kom Correns med följande, som han kallade det, "kätteri":

Jag föreslår att platsen för Anlagen, utan permanent fixering, är i kärnan, särskilt i kromosomerna. Dessutom antar jag, utanför kärnan, i protoplasma, en mekanism som tar hand om deras utplacering. Då kan Anlagen blandas som de kan, som de färgade små stenarna i ett kalejdoskop; och ändå utvecklas de på rätt plats ([1901], citerat från Correns 1924, 279).

På detta sätt skilde Correns i början av det första decenniet av det tjugonde århundradet ett ärftligt utrymme med en oberoende logik och mätvärden från ett annat, fysiologiskt och utvecklingsutrymme representerat av cytoplasma. Mot slutet av det första decenniet av det tjugonde århundradet, efter att Bateson hade myntat termen genetik för det nya nya området för överföringsstudier 1906, kodifierade Wilhelm Johannsen denna distinktion genom att introducera begreppen genotyp respektive fenotyp för dessa två utrymmen. I motsats till Correns betraktade Johannsen genotyop och fenotyp som abstrakta enheter, inte begränsade dem till vissa cellulära utrymmen och förblev skeptisk till kromosomteorin om arv under hela sitt liv. Dessutom föreslog Johannsen för elementen i genotypen begreppet gen,som för honom var ett begrepp "helt fritt från någon hypotes" angående lokalisering och materiell konstitution (Johannsen 1909, 124).

Johannsens kodifiering, som baserades på mikrobiologiens "ren kultur" -metod, uppfödarens praxis att separera "rena linjer" samt Richard Wolterecks uppfattning om en medfödd "reaktionsnorm", togs gradvis upp av genetikssamhället och har djupt markerat hela det tjugonde århundradets biologi (Allen 2002, Müller-Wille 2007). Vi kan säkert säga att den inrättade genen som ett epistemiskt objekt som skulle studeras inom dess rätta utrymme, och med det en "exakt, experimentell doktrin om ärftlighet" (Johannsen 1909, 1) som endast koncentrerades på överföring och inte på utvecklingen av organismen i sin miljö. Vissa historiker har talat om en "skilsmässa" av genetiska från embryologiska problem med avseende på denna separering (Allen 1986; Bowler 1989). Andra anser att denna separation i sig var ett uttryck för de tidiga genetikernas embryologiska intressen i deras sökning efter”utvecklingsinvarianter” (Gilbert 1978; Griesemer 2000). Oavsett om det var, var resultatet att förhållandena mellan de två rymden, en gång separerade genom abstraktion, nu klargjordes experimentellt i sin egen rätt (Falk 1995). Michel Morange observerade att denna "uppdelning var logiskt absurd" - från efterhand men - "historiskt och vetenskapligt nödvändigt" (Morange 2001, 9). Michel Morange observerade att denna "uppdelning var logiskt absurd" - från efterhand men - "historiskt och vetenskapligt nödvändigt" (Morange 2001, 9). Michel Morange observerade att denna "uppdelning var logiskt absurd" - från efterhand men - "historiskt och vetenskapligt nödvändigt" (Morange 2001, 9).

Johannsen själv betonade att genotypen måste behandlas som oberoende av någon livshistoria och därmed, åtminstone inom de tidsgränser som forskningen verkade, som en "ahistorisk" enhet som kan komma till vetenskaplig granskning som fysikens och kemins föremål (Johannsen 1911, 139; jfr Churchill 1974; Roll-Hansen 1978 a).”De individuella organismernas personliga egenskaper orsakar inte alls dess avkommers egenskaper; men egenskaperna hos både förfader och efterföljande bestäms på samma sätt som de sexuella ämnernas natur,”hävdade Johannsen (Johannsen 1911, 130). Till skillnad från de flesta Mendelians, förblev han dock övertygad om att genotypen skulle ha en övergripande arkitektur - vilket uttrycks i begreppet "typ". Han hade därför reservationer med avseende på dess partikelformiga natur,och varnade särskilt för att begreppet”gener för en viss karaktär” alltid bör användas med försiktighet om inte helt utelämnas (Johannsen 1911, 147). Johannsen förblev också medvetet agnostisk med avseende på genotypens materiella sammansättning och dess element. Han insåg tydligt att den experimentella regimen för Mendelian genetik, även om den är vetenskaplig i sin karaktär som fysik eller kemi, varken krävde eller möjliggjorde någon bestämd antagning om de genetiska elementens materialstruktur.”Personligen,” skrev han så sent som 1923,”jag tror på ett mycket centralt någonting som ännu inte är delbart i separata faktorer,” och identifierar detta”något” med organismens specifika natur. "Grymflugorna i Morgans fantastiska experiment," förklarade han,”Fortsätter att vara gräsflugor även om de förlorar alla goda gener som är nödvändiga för ett normalt flugliv, eller om de är besatt av alla dåliga gener, vilket skadar välfärden för denna lilla vän till genetikern” (Johannsen 1923, 137).

Därför togs gener som abstrakta element i ett lika abstrakt utrymme, vars struktur emellertid kunde utforskas genom det synliga och kvantifierbara resultatet av avelexperiment baserade på modellorganismer och deras mutanter. Detta blev forskningsprogrammet för Thomas Hunt Morgan och hans grupp. Från början av 1910-talet strax in på 1930-talet använde det växande samhället av forskare runt Morgan och deras följare mutanter av fruktflugan Drosophila melanogaster, konstruerade på allt mer sofistikerade sätt, för att producera en karta över fruktfluens genotyp där gener, och alleler därav, tänkta som genetiska markörer som upptar ett speciellt lokus på ett av de fyra homologa kromosompar av flugan (Kohler 1994). De grundläggande antagandena som gjorde det möjligt för programmet att fungera var att gener var belägna i en linjär ordning längs de olika kromosomerna (som "pärlor på en sträng" som Morgan uttryckte det 1926, 24), och att frekvensen av rekombinationshändelser mellan homologa kromosomer, det vill säga frekvensen av korsningar under reduktionsdelning, gav ett mått på avståndet mellan generna, samtidigt som de definierade dem som enheter av rekombination (Morgan et al. 1915).

I denna praxis användes identifierbara aspekter av fenotypen, antagna att bestämmas direkt av gener på ett medvetet svartboxat sätt, som indikatorer eller fönster för en syn på genotypens formella struktur. Detta är vad Moss har benämnt "Gen-P" (P står för fenotyp, men också för preformationist; Moss 2003, 45 - för motsvarigheten, "Gen-D", se nedan). Under hela sin karriär förblev Morgan medveten om den formella karaktären i sitt program. Så sent som 1933 förklarade han, i anledning av hans Nobeladress: "På den nivå där de genetiska experimenten ligger, gör det inte den minsta skillnaden om genen är en hypotetisk enhet eller om genen är en materiell partikel" (Morgan 1935, 3). Särskilt spelade det ingen roll om en-till-en,eller mer komplicerade relationer regerade mellan gener och drag (Waters 1994). Morgan och hans skola var medvetna om att många gener som regel var involverade i utvecklingen av ett speciellt drag som t.ex. ögonfärg, och att en gen kunde påverka flera karaktärer. För att tillmötesgå denna svårighet och i linje med deras experimentella regi, omfattade de ett differentiellt begrepp av genen. Det som betydde för dem var förhållandet mellan en förändring i en gen och en förändring i en egenskap snarare än arten av dessa enheter själva. Således kan förändringen av ett drag vara orsakligt relaterat till en förändring i (eller förlust av) en enda genetisk faktor, även om det i allmänhet var troligt att ett drag som ögonfärg faktiskt bestämdes av en hel grupp av olika växelverkande gener (Roll-Hansen 1978 b; Schwartz 2000). Morgan och hans skola var medvetna om att många gener som regel var involverade i utvecklingen av ett speciellt drag som t.ex. ögonfärg, och att en gen kunde påverka flera karaktärer. För att tillmötesgå denna svårighet och i linje med deras experimentella regi, omfattade de ett differentiellt begrepp av genen. Det som betydde för dem var förhållandet mellan en förändring i en gen och en förändring i en egenskap snarare än arten av dessa enheter själva. Således kan förändringen av ett drag vara orsakligt relaterat till en förändring i (eller förlust av) en enda genetisk faktor, även om det i allmänhet var troligt att ett drag som ögonfärg faktiskt bestämdes av en hel grupp av olika växelverkande gener (Roll-Hansen 1978 b; Schwartz 2000). Morgan och hans skola var medvetna om att många gener som regel var involverade i utvecklingen av ett speciellt drag som t.ex. ögonfärg, och att en gen kunde påverka flera karaktärer. För att tillmötesgå denna svårighet och i linje med deras experimentella regi, omfattade de ett differentiellt begrepp av genen. Det som betydde för dem var förhållandet mellan en förändring i en gen och en förändring i en egenskap snarare än arten av dessa enheter själva. Således kan förändringen av ett drag vara orsakligt relaterat till en förändring i (eller förlust av) en enda genetisk faktor, även om det i allmänhet var troligt att ett drag som ögonfärg faktiskt bestämdes av en hel grupp av olika växelverkande gener (Roll-Hansen 1978 b; Schwartz 2000).många gener var involverade i utvecklingen av ett visst drag som t.ex. ögonfärg, och att en gen kunde påverka flera tecken. För att tillmötesgå denna svårighet och i linje med deras experimentella regi, omfattade de ett differentiellt begrepp av genen. Det som betydde för dem var förhållandet mellan en förändring i en gen och en förändring i en egenskap snarare än arten av dessa enheter själva. Således kan förändringen av ett drag vara orsakligt relaterat till en förändring i (eller förlust av) en enda genetisk faktor, även om det i allmänhet var troligt att ett drag som ögonfärg faktiskt bestämdes av en hel grupp av olika växelverkande gener (Roll-Hansen 1978 b; Schwartz 2000).många gener var involverade i utvecklingen av ett visst drag som t.ex. ögonfärg, och att en gen kunde påverka flera tecken. För att tillmötesgå denna svårighet och i linje med deras experimentella regi, omfattade de ett differentiellt begrepp av genen. Det som betydde för dem var förhållandet mellan en förändring i en gen och en förändring i en egenskap snarare än arten av dessa enheter själva. Således kan förändringen av ett drag vara orsakligt relaterat till en förändring i (eller förlust av) en enda genetisk faktor, även om det i allmänhet var troligt att ett drag som ögonfärg faktiskt bestämdes av en hel grupp av olika växelverkande gener (Roll-Hansen 1978 b; Schwartz 2000).de omfamnade ett differentiellt begrepp av genen. Det som betydde för dem var förhållandet mellan en förändring i en gen och en förändring i en egenskap snarare än arten av dessa enheter själva. Således kan förändringen av ett drag vara orsakligt relaterat till en förändring i (eller förlust av) en enda genetisk faktor, även om det i allmänhet var troligt att ett drag som ögonfärg faktiskt bestämdes av en hel grupp av olika växelverkande gener (Roll-Hansen 1978 b; Schwartz 2000).de omfamnade ett differentiellt begrepp av genen. Det som betydde för dem var förhållandet mellan en förändring i en gen och en förändring i en egenskap snarare än arten av dessa enheter själva. Således kan förändringen av ett drag vara orsakligt relaterat till en förändring i (eller förlust av) en enda genetisk faktor, även om det i allmänhet var troligt att ett drag som ögonfärg faktiskt bestämdes av en hel grupp av olika växelverkande gener (Roll-Hansen 1978 b; Schwartz 2000).bestämd av en hel grupp olika interagerande gener (Roll-Hansen 1978 b; Schwartz 2000).bestämd av en hel grupp olika interagerande gener (Roll-Hansen 1978 b; Schwartz 2000).

Fascinationen av detta genbegrepp bestod i det faktum att det fungerade, om det tillämpades korrekt, som ett precisionsinstrument i utvecklings- och evolutionära studier. Å ena sidan tillät den klassiska genen att identifiera utvecklingsprocesser över generationer. Som en konsekvens integrerades förfaranden inom klassisk genetik snart med panopiken av metoder som embryologer hade utvecklat sedan slutet av nittonde för att "spåra" utvecklingen. (Griesemer 2007). Å andra sidan skulle matematiska populationsgenetiker som Ronald A. Fisher, JBS Haldane och Sewall Wright kunna använda den klassiska genen med lika hårdhet och precision för att utarbeta testbara matematiska modeller som beskriver effekterna av evolutionära faktorer som selektion och mutation på den genetiska populationernas sammansättning (Provine 1971). Som en följd av detta definierades evolutionen som en förändring av genfrekvenser i genens pool av en befolkning i det som vanligtvis kallas”evolutionär”,”neo-Darwinian” eller helt enkelt”modern syntes” i slutet av 1930-talet och början av 1940-talet (Mayr & Provine 1980, Gayon 1998). Den klassiska genen betraktas som en "utvecklingsinvariant" i reproduktionen och endast följer Mendeliska lagarna vid överföring från en generation till nästa. Den klassiska genen tillhandahöll en slags tröghetsprincip mot vilken effekterna av både utvecklings (epistas, hämning, positionseffekter etc.)) och evolutionära faktorer (selektion, mutation, isolering, rekombination etc.) kunde mätas med största noggrannhet (Gayon 1995, 74). Vi kommer att gå igenom den evolutionära syntesen i det tredje avsnittet; för resten av detta avsnitt,vi skulle vilja vända oss till den tidiga historien om utvecklingsgenetik, som spelade en viktig roll i eventuell”reification” av genen.

Trots den klassiska genens formella karaktär blev det övertygelsen av många genetiker på 1920-talet, bland dem Morgans student Herman J. Muller, att gener måste vara materialpartiklar. Muller såg gener som grundläggande försett med två egenskaper: autokatalysen och heterokatalysen. Deras autokatalytiska funktion gjorde det möjligt för dem att reproducera sig som överföringsenheter och därmed ansluta genotypen från en generation till den nästa. Deras samtidiga förmåga att reproducera mutationer troget när de inträffat gav upphov till, av detta skäl, möjligheten till evolution. Deras heterokatalytiska förmågor kopplade dem till fenotypen som funktionsenheter involverade i uttrycket av en viss karaktär. Med sitt eget experimentella arbete tilllade Muller ett betydande argument för genens materialitet,avser den tredje aspekten av genen som en mutationsenhet. 1927 rapporterade han om induktion av Mendeliska mutationer i Drosophila med hjälp av röntgenstrålar. Han var inte den första som använde strålning för att inducera mutationer, men sticker ut för sin slutsats att röntgenstrålar orsakade mutationer genom att ändra någon molekylstruktur på ett permanent sätt och därmed ge upphov till en hel "industri" av strålningsgenetik på 1930-talet och 1940-talet.

Men den experimentella praktiken med röntgenstrålning ensam kunde inte öppna vägen för en materiell karakterisering av gener som arvsenheter. I anledning av femtioårsdagen av återupptäckten av Mendels arbete 1950 var Muller således tvungen att erkänna:”[T] hans verkliga kärna i genteori verkar fortfarande ligga i det djupa okända. Det vill säga, vi har ännu ingen faktisk kunskap om den mekanism som ligger till grund för den unika egenskapen som gör en gen till en gen - dess förmåga att orsaka syntesen av en annan struktur som sig själv, [till och med, till och med mutationerna av den ursprungliga genen kopieras. [Vi] vet inte om sådana saker ännu inom kemi”(Muller 1951, 95-96).

Under tiden hade cytologiskt arbete också lagt tilltro till materialiteten hos gener-på-kromosomer. Samtidigt komplicerade det emellertid uppfattningen om den klassiska genen. Under 1930-talet korrelerade cytogeneticisten Theophilus Painter formella mönster för förskjutning av genetiska loci på morganiska kromosomkartor med motsvarande synliga förändringar i bandmönstret för jätte spottkörtelkromosomer i Drosophila. Barbara McClintock kunde följa med sitt mikroskop de förändringar-translokationer, inversioner och raderingar som inducerats av röntgenstrålar i kromosomerna i Zea mays (majs). Samtidigt hade Alfred Sturtevant i sitt experimentella arbete med Bar-eye-effekten i Drosophila i slutet av 1920-talet visat vad som kom att kallas en positionseffekt:uttrycket av en mutation var beroende av den position som motsvarande gen upptog i kromosomen. Denna upptäckt väckte vidsträckta diskussioner om vad Muller hade kallat den heterokatalytiska aspekten av en gen, nämligen dess funktionella associering med uttrycket av en viss fenotypisk egenskap. Om en genfunktion var beroende av sin position på kromosomen, blev det ifrågasatt om den funktionen var stabilt kopplad till den genen alls, eller som Richard Goldschmidt senare antog, om fysiologisk funktion inte helt och hållet var en fråga om organisationen av det genetiska materialet som en helhet snarare än av partikelformiga gener (Goldschmidt 1940; jfr. Dietrich 2000 och Richmond 2007). Denna upptäckt väckte vidsträckta diskussioner om vad Muller hade kallat den heterokatalytiska aspekten av en gen, nämligen dess funktionella associering med uttrycket av en viss fenotypisk egenskap. Om en genfunktion var beroende av sin position på kromosomen, blev det ifrågasatt om den funktionen var stabilt kopplad till den genen alls, eller som Richard Goldschmidt senare antog, om fysiologisk funktion inte helt och hållet var en fråga om organisationen av det genetiska materialet som en helhet snarare än av partikelformiga gener (Goldschmidt 1940; jfr. Dietrich 2000 och Richmond 2007). Denna upptäckt väckte vidsträckta diskussioner om vad Muller hade kallat den heterokatalytiska aspekten av en gen, nämligen dess funktionella associering med uttrycket av en viss fenotypisk egenskap. Om en genfunktion var beroende av sin position på kromosomen, blev det ifrågasatt om denna funktion alls var stabilt kopplad till den genen, eller som Richard Goldschmidt senare antog, om fysiologisk funktion inte helt och hållet var en fråga om organisationen av det genetiska materialet som en helhet snarare än av partikelformiga gener (Goldschmidt 1940; jfr. Dietrich 2000 och Richmond 2007).eller som Richard Goldschmidt senare antog, huruvida fysiologisk funktion inte helt och hållet var en fråga om organisationen av det genetiska materialet som helhet snarare än av partikelformiga gener (Goldschmidt 1940; jfr. Dietrich 2000 och Richmond 2007).eller som Richard Goldschmidt senare antog, huruvida fysiologisk funktion inte helt och hållet var en fråga om organisationen av det genetiska materialet som helhet snarare än av partikelformiga gener (Goldschmidt 1940; jfr. Dietrich 2000 och Richmond 2007).

Hittills har alla experimentella metoder för det nya genetiska fältet och dess antagna element, generna, varit tyst med avseende på de två grundläggande Mullerianska aspekterna av genen: dess autokatalytiska och dess heterokatalytiska funktion. Mot slutet av 1930-talet hade Max Delbrück intuitionen att frågan om autokatalys, det vill säga replikering, kunde attackeras genom studiet av fag, dvs. virus som replikeras i bakterier. Det har emellertid noterats att fagsystemet, som han etablerade under 1940-talet, i stort sett förblev lika formellt som det för klassisk Drosophila-genetik. Seymour Benzer, till exempel, använde detta system på ett helt "klassiskt" sätt för att öka upplösningskraften för genetiska kartläggningstekniker ner till avstånd från några få nukleotidpar och förberedde således marken för Francis Cricks sekvenshypotes. Intressant nog kom Benzer till slutsatsen att "gen" var ett "smutsigt ord", eftersom genens slutna molekylära dimensioner som en funktionsenhet, rekombination och mutation tydligt skilde sig åt. Följaktligen föreslog han att man hänvisade till genetiska element som cistroner, reconer respektive mutoner (Holmes 2006).

Ungefär samma tid kunde Alfred Kühn och hans grupp, såväl som Boris Ephrussi med George Beadle, öppna ett fönster på utrymmet mellan genen och dess antagna fysiologiska funktion genom att transplantera organ mellan mutanta och vilda typinsekter. De studerade pigmenteringen av insektsögon och insåg att gener inte direkt gav upphov till fysiologiska substanser, men att de uppenbarligen först initierade vad Kühn kallade en "primär reaktion" som ledde till jäsningar eller enzymer, som i sin tur katalyserade särskilda steg i metaboliska reaktionskaskader.. 1941 sammanfattade Kühn perspektivet på denna typ av "utvecklings-fysiologisk genetik", som han kallade det:

Vi står bara i början av en enorm forskningsdomän. [Vår] förståelse för uttrycket av ärftliga egenskaper förändras från en mer eller mindre statisk och preformistisk uppfattning till en dynamisk och epigenetisk. Den formella korrelationen mellan enskilda gener som är mappade till specifika platser på kromosomerna med vissa karaktärer har bara en begränsad betydelse. Varje steg i förverkligandet av karaktärer är så att säga en nod i ett nätverk av reaktionskedjor från vilka många genhandlingar strålar. En egenskap tycks ha en enkel korrelation till en gen endast så länge de andra generna i samma handlingskedja och andra handlingskedjor som ingår i samma nod förblir desamma. Endast en metodiskt genomförd genetisk,utvecklings- och fysiologisk analys av ett stort antal enstaka mutationer kan gradvis avslöja den drivande verkan hos de ärftliga dispositionerna (das Wirkgetriebe der Erbanlagen) (Kühn 1941, 258).

Kühn betraktade sina experiment som början på en omorientering bort från vad han uppfattade som den nya preformationism av överföringsgenetik (Rheinberger 2000a). Han bad om en epigenetik som skulle kombinera genetiska, utvecklingsmässiga och fysiologiska analyser för att definiera heterokatalys, det vill säga uttrycket av en gen, som ett resultat av en interaktion mellan två reaktionskedjor, en som leder från gener till speciella jäsningar och den andra som leder från en metabolisk mellanprodukt till nästa genom ingripande av dessa ferment, vilket resulterar i komplexa epigenetiska nätverk. Men hans egen experimentella praxis under 1940-talet ledde till att han stannade vid slutförandet av vägen för ögonpigmentbildning i Ephestia kühniella (mjölmallen). Han försökte inte utveckla experimentella instrument för att attackera gen-enzymrelationerna själva som är inblandade i processen. På andra sidan Atlanten kodifierade George Beadle och Edward Tatum, som arbetade med kulturer av Neurospora crassa, den senare anslutningen till den ena genen-enzymhypotesen. Men också för dem förblev den materiella karaktären hos generna och hur dessa förmodade enheter gav upphov till primära produkter svårfångade och utanför deras egna biokemiska analys.generens materiella karaktär och hur dessa förmodade enheter gav upphov till primära produkter förblev svårfångade och utanför deras egna biokemiska analys.generens materiella karaktär och hur dessa förmodade enheter gav upphov till primära produkter förblev svårfångade och utanför deras egna biokemiska analys.

På 1940-talet var genen i klassisk genetik alltså långt ifrån en enkel uppfattning som motsvarar en enkel enhet. Med tanke på genen som en enhet för överföring, rekombination, mutation och funktion kombinerade klassiska genetiker olika aspekter av ärftliga fenomen vars sammanhang, som regel, visade sig inte vara enkla en-till-en-förhållanden. På grund av bristen på kunskap om genens materiella natur förblev emellertid den klassiska genen i stort sett ett formellt och operativt begrepp, dvs. måste indirekt underbyggas av framgångarna för att förklara och förutsäga experimentella resultat. Denna brist trots att de olika forskningssträngarna i klassificerad genetik har ökat, ledde till en "härdning" av tron på genen som en diskret, materiell enhet (Falk 2000,323-26).

3. Genen i molekylär genetik

Enzymbilden av genfunktion, som förutses av Kühn och av Beadle och Tatum, men med försiktigt förbehåll, gav idén om genetisk specificitet en ny vridning och hjälpte till att bana väg till molekyleringen av genen som detta avsnitt kommer att ägnas åt (se även Kay 1993). Detsamma kan sägas om resultaten från Oswald Avery och hans kollegor i början av 1940-talet. De renade deoxyribonuleinsyran från en bakteriestam och visade att den kunde överföra den smittsamma karaktären hos denna stam till en annan, ofarlig. Ändå var den historiska vägen som ledde till en förståelse av molekylgenens natur inte en direkt uppföljning av klassisk genetik (jfr. Olby 1974 och Morange 2000a). Det var ganska inbäddat i en överdriven molekylisering av biologi som drivs av tillämpningen av nyutvecklade fysiska och kemiska metoder och instrument på biologiska problem, inklusive genetik. Bland dessa metoder var ultracentrifugering, röntgenkristallografi, elektronmikroskopi, elektrofores, makromolekylär sekvensering och radioaktiv spårning. I det biologiska slutet förlitade sig det på övergången till nya, jämförelsevis enkla modellorganismer som encellsvamp, bakterier, virus och fag. En ny kultur av fysiskt och kemiskt instruerad in vitro-biologi ledde till att i stora delar inte längre vilade på närvaron av intakta organismer i ett visst experimentellt system (Rheinberger 1997; Landecker 2007). Bland dessa metoder var ultracentrifugering, röntgenkristallografi, elektronmikroskopi, elektrofores, makromolekylär sekvensering och radioaktiv spårning. I det biologiska slutet förlitade sig det på övergången till nya, jämförelsevis enkla modellorganismer som encellsvamp, bakterier, virus och fag. En ny kultur av fysiskt och kemiskt instruerad in vitro-biologi ledde till att i stora delar inte längre vilade på närvaron av intakta organismer i ett visst experimentellt system (Rheinberger 1997; Landecker 2007). Bland dessa metoder var ultracentrifugering, röntgenkristallografi, elektronmikroskopi, elektrofores, makromolekylär sekvensering och radioaktiv spårning. I det biologiska slutet förlitade sig det på övergången till nya, jämförelsevis enkla modellorganismer som encellsvamp, bakterier, virus och fag. En ny kultur av fysiskt och kemiskt instruerad in vitro-biologi ledde till att i stora delar inte längre vilade på närvaron av intakta organismer i ett visst experimentellt system (Rheinberger 1997; Landecker 2007). En ny kultur av fysiskt och kemiskt instruerad in vitro-biologi ledde till att i stora delar inte längre vilade på närvaron av intakta organismer i ett visst experimentellt system (Rheinberger 1997; Landecker 2007). En ny kultur av fysiskt och kemiskt instruerad in vitro-biologi ledde till att i stora delar inte längre vilade på närvaron av intakta organismer i ett visst experimentellt system (Rheinberger 1997; Landecker 2007).

För utvecklingen av molekylär genetik i smalare bemärkelse visade sig att tre rader med experimentell undersökning var avgörande. De var inte kopplade till varandra när de fick fart i slutet av 1940-talet, men de råkade samman i början av 1960-talet och gav upphov till en storslagen ny bild. Den första av dessa utvecklingar var belysningen av strukturen av deoxiribonukleinsyra (DNA) som en makromolekylär dubbel spiral av Francis Crick och James D. Watson 1953. Detta arbete baserades på kemisk information om baskompositionen i molekylen tillhandahållen av Erwin Chargaff, om data från röntgenkristallografi producerad av Rosalind Franklin och Maurice Wilkins, och om mekanisk modellbyggnad som utvecklats av Linus Pauling. Resultatet var en bild av en dubbel nukleinsyrasträng vars fyra baser (Adenine, Thymine, Guanine,Cytosin) bildade komplementära par (AT, GC) som kunde arrangeras i alla möjliga kombinationer till långa linjära sekvenser. Samtidigt föreslog den molekylära modellen en elegant mekanism för duplicering av molekylen. Att öppna trådarna och syntetisera två nya trådar som är komplementära till var och en av de separerade trådarna respektive skulle räcka för att skapa två identiska spiraler från en. Detta visade sig verkligen vara fallet, även om dupliceringsprocessen skulle ses som förlitande på en komplicerad molekylär replikationsmaskin. Således hade strukturen för den dubbla helixen av DNA alla de egenskaper som skulle förväntas från en molekyl som tjänade som en autokatalytisk ärftlig enhet (Chadarevian 2002). Samtidigt föreslog den molekylära modellen en elegant mekanism för duplicering av molekylen. Att öppna trådarna och syntetisera två nya trådar som är komplementära till var och en av de separerade trådarna respektive skulle räcka för att skapa två identiska spiraler från en. Detta visade sig verkligen vara fallet, även om dupliceringsprocessen skulle ses som förlitande på en komplicerad molekylär replikationsmaskin. Således hade strukturen för den dubbla helixen av DNA alla de egenskaper som skulle förväntas från en molekyl som tjänade som en autokatalytisk ärftlig enhet (Chadarevian 2002). Samtidigt föreslog den molekylära modellen en elegant mekanism för duplicering av molekylen. Att öppna trådarna och syntetisera två nya trådar som är komplementära till var och en av de separerade trådarna respektive skulle räcka för att skapa två identiska spiraler från en. Detta visade sig verkligen vara fallet, även om dupliceringsprocessen skulle ses som förlitande på en komplicerad molekylär replikationsmaskin. Således hade strukturen för den dubbla helixen av DNA alla de egenskaper som skulle förväntas från en molekyl som tjänade som en autokatalytisk ärftlig enhet (Chadarevian 2002). Att öppna trådarna och syntetisera två nya trådar som är komplementära till var och en av de separerade trådarna respektive skulle räcka för att skapa två identiska spiraler från en. Detta visade sig verkligen vara fallet, även om dupliceringsprocessen skulle ses som förlitande på en komplicerad molekylär replikationsmaskin. Således hade strukturen hos den dubbla helixen av DNA alla de egenskaper som kunde förväntas från en molekyl som tjänade som en autokatalytisk ärftlig enhet (Chadarevian 2002). Att öppna trådarna och syntetisera två nya trådar som är komplementära till var och en av de separerade trådarna respektive skulle räcka för att skapa två identiska spiraler från en. Detta visade sig verkligen vara fallet, även om dupliceringsprocessen skulle ses som förlitande på en komplicerad molekylär replikationsmaskin. Således hade strukturen för den dubbla helixen av DNA alla de egenskaper som skulle förväntas från en molekyl som tjänade som en autokatalytisk ärftlig enhet (Chadarevian 2002).

Den andra raden av experiment som bildade molekylär genetik var in vitro-karakteriseringen av processen med proteinbiosyntes som många biokemiskt fungerande forskare bidrog till, bland dem Paul Zamecnik, Mahlon Hoagland, Paul Berg, Fritz Lipmann, Marshall Nirenberg och Heinrich Matthaei. Det började på 1940-talet till stor del som ett försök att förstå tillväxten av maligna tumörer. Under 1950-talet blev det uppenbart att processen krävde en RNA-mall som ursprungligen ansågs vara en del av mikrosomerna på vilka sammansättningen av aminosyror ägde rum. Dessutom visade det sig att processen med aminosyrakondensation förmedlades av en överföringsmolekyl med egenskaperna hos en nukleinsyra och kapaciteten att bära en aminosyra. Den efterföljande idén att det var en linjär sekvens av ribonukleinsyra härledd från en av DNA-strängarna som riktade syntesen av en linjär sekvens av aminosyror, eller en polypeptid, och att denna process medierades av en adaptermolekyl, bekräftades snart experimentellt (Rheinberger 1997). Förhållandet mellan dessa två klasser av molekyler befanns så småningom styras av en nukleinsyratriplettkod, som bestod i tre baser åt gången som specificerade en aminosyra (Kay 2000, kap. 6); följaktligen sekvenshypotesen och molekylärbiologiens centrala dogma, som Francis Crick formulerade i slutet av 1950-talet:Förhållandet mellan dessa två klasser av molekyler befanns så småningom styras av en nukleinsyratriplettkod, som bestod i tre baser åt gången som specificerade en aminosyra (Kay 2000, kap. 6); följaktligen sekvenshypotesen och molekylärbiologiens centrala dogma, som Francis Crick formulerade i slutet av 1950-talet:Förhållandet mellan dessa två klasser av molekyler befanns så småningom styras av en nukleinsyratriplettkod, som bestod i tre baser åt gången som specificerade en aminosyra (Kay 2000, kap. 6); följaktligen sekvenshypotesen och molekylärbiologiens centrala dogma, som Francis Crick formulerade i slutet av 1950-talet:

I sin enklaste form antar [sekvenshypotesen] att specificiteten för en bit nukleinsyra uttrycks enbart av sekvensen för dess baser, och att denna sekvens är en (enkel) kod för aminosyrasekvensen för ett specifikt protein. [Den centrala dogmen] säger att när”information” har gått in i protein kan den inte komma ut igen. Mer detaljerat kan överföring av information från nukleinsyra till nukleinsyra eller från nukleinsyra till protein vara möjlig, men överföring från protein till protein eller från protein till nukleinsyra är omöjligt. Information betyder här den exakta bestämningen av sekvensen, antingen av baser i nukleinsyran eller av aminosyrarester i proteinet (Crick 1958, 152-153).

Med dessa två grundläggande antaganden kom en ny syn på biologisk specificitet in. Det var centrerat på överföringen av molekylordning från en makromolekyl till den andra. I en molekyl bevaras ordningen strukturellt; i den andra uttrycks det och ger grunden för en biologisk funktion. Denna överföringsprocess karakteriserades som molekylär informationsöverföring. Hittills kan gener ses som sträckor av deoxiribonukleinsyra (eller ribonukleinsyra i vissa virus) som bär informationen för montering av ett specifikt protein. Båda molekylerna ansågs således vara kolinära, och detta visade sig verkligen vara fallet för många bakteriegener. I slutändan var både grundläggande egenskaper som Muller krävde för gener, nämligen autokatalys och heterokatalys,uppfattades som förlitar sig på en och samma stereokemiska princip respektive: Baskomplementariteten mellan nukleinsyrabyggnadsblock C / G och A / T (U i fallet med RNA) var båda ansvariga för den trogna dupliceringen av genetisk information i processen med replikering och via den genetiska koden för omvandling av genetisk information till biologisk funktion genom transkription till RNA och translation till proteiner.

Koden visade sig vara nästan universell för alla klasser av levande varelser, liksom mekanismerna för transkription och översättning. Genotypen omkonfigurerades således som ett universellt förvar med genetisk information, ibland även behandlat som ett genetiskt program. Prat om DNA som förkroppsligar genetisk”information” som”livets plan” som styr den offentliga diskursen fram till idag, uppstod från en speciell sammankoppling av fysiska och livsvetenskaper under andra världskriget, med Erwin Schrödingers What is Life? som inspirationskälla (Schrödinger 1944) och cybernetik som den då ledande disciplinen i studien av komplexa system. Det måste dock betonas att de första försöken att "knäcka" DNA-koden med rent kryptografiska medel snart stötte på en återvändsgränd. Slutligen var det biokemister som upptäckte den genetiska koden genom avancerade verktyg för deras disciplin (Judson 1996; Kay 2000).

För att vidareutveckla begreppet DNA som ett "program" måste vi överväga en ytterligare tredje rad av experiment, bortsett från belysningen av DNA-strukturen och mekanismerna för proteinsyntes. Denna experimentlinje kom ut ur en sammansmältning av bakteriell genetik med den biokemiska karaktäriseringen av ett inducerbart system av sockermetaboliserande enzymer. Det var till stor del arbetet med François Jacob och Jacques Monod och ledde i början av 1960-talet till identifiering av messenger RNA som medlaren mellan gener och proteiner och till beskrivningen av en reglerande modell för genaktivering, den så kallade operon-modell, i vilken två klasser av gener utmärktes: En klass var den av strukturella gener. De antogs ha "strukturinformation" för framställning av speciella polypeptider. Den andra klassen var reglerande gener. De antogs vara involverade i regleringen av uttrycket av strukturell information (hur denna distinktion utmanades nyligen diskuteras i Piro 2011). Ett tredje element av DNA involverat i regleringsslingan för en operon var ett bindningsställe eller signalsekvens som inte transkriberades alls.

Dessa tre element, strukturella gener, regulatoriska gener och signalsekvenser gav ramarna för att betrakta genotypen som ett ordnat, hierarkiskt system, som ett "genetiskt program", som Jacob hävdade, inte utan att lägga till att det var ett mycket speciellt program, nämligen en som behövde sina egna produkter för att kunna köras:”Det finns bara den oavbrutna exekveringen av ett program som är oskiljaktigt från dess genomförande. För de enda elementen som kan tolka det genetiska budskapet är produkterna från det meddelandet”(Jacob 1976, 297). Om vi tar denna åsikt på allvar, även om hela uppfattningen ser ut som en cirkel och har kritiserats som sådan (Keller 2000), är det i slutändan organismen som tolkar eller "rekryterar" de strukturella generna genom att aktivera eller hämma de reglerande generna som kontrollera deras uttryck.

Operonmodellen av Jacob och Monod markerade således det brantfallande slutet av det enkla, informativa konceptet för molekylgenen. Sedan början av 1960-talet har bilden av genuttryck blivit mycket mer komplicerad (jämför följande Rheinberger 2000b). Dessutom verkar de flesta genomer av högre organismer innefatta enorma DNA-sträckor till vilka ännu ingen funktion kan tilldelas. "Icke-kodande", men funktionellt specifika, reglerande DNA-element har spridit sig: Det finns promotor- och terminatorsekvenser; aktiverande element uppströms och nedströms i transkriberade eller icke-transkriberade, översatta eller otranslaterade regioner; ledarsekvenser; externt och internt transkriven distanser före, mellan och efter strukturella gener; inblandade repetitiva element och tandemiskt upprepade sekvenser som satelliter,LINJER (långa varandra varandra sekvenser) och SINE (korta isär varandra sekvenser) i olika klasser och storlekar. Med tanke på alla de förvirrande detaljerna om dessa element, kommer det inte som någon överraskning att deras molekylära funktion fortfarande är långt ifrån att förstås fullt ut (för en översikt se Fischer 1995).

När det gäller transkription, dvs syntesen av en RNA-kopia från en DNA-sekvens, har överlappande läsramar hittats på en och samma DNA-sträng, och proteinkodande sträckor har visat sig härleda från båda strängarna av den dubbla spiralen på ett överlappande sätt. På modifieringsnivån efter transkription har bilden blivit lika komplicerad. Redan på 1960-talet insåg man att DNA-transkript såsom överförings-RNA och ribosomalt RNA måste trimmas och mognas på ett komplext enzymatiskt sätt för att bli funktionella molekyler, och att budbärar-RNA av eukaryoter genomgick omfattande posttranscriptional modifiering båda vid deras 5'-ändar (capping) och deras 3'-ändar (polyadenylering) innan de var redo att gå in i översättningsmaskineriet. Under 1970-talet, till alla förvånande,Phillip Allen Sharp och Richard J. Roberts fann oberoende att eukaryota gener var sammansatta av moduler, och att efter transkription klipptes introner ut och exoner skarvades ihop för att ge ett funktionellt meddelande.

"Gen-i-bitarna" (Gilbert 1978) var en av de första stora vetenskapliga utskjutningarna av rekombinant DNA-teknik, och denna teknik har sedan dess fortsatt varit bra för oförutsedda vyer på genomet och bearbetningen av dess enheter. En skarvad budbärare kan ibland innefatta en bråk så lite som tio procent eller mindre av det primära transkriptet. Sedan slutet av 1970-talet har molekylärbiologer blivit bekanta med olika typer av RNA-skarvning autokatalytisk självskärning, alternativ skarvning av ett enda transkript för att ge olika meddelanden och till och med transsplitsning av olika primära transkript för att ge ett hybridmeddelande. När det gäller äggläggningshormonet hos Aplysia, för att bara ta ett exempel, ger en och samma DNA-sträcka elva proteinprodukter som är involverade i denna snigels reproduktiva beteende. Till sist,ännu en mekanism, eller snarare, klass av mekanismer har visat sig fungera på nivån av RNA-transkript. Det kallas messenger RNA-redigering. I det här fallet - som under tiden har visat sig inte bara vara en exotisk nyfikenhet för vissa trypanosomer - är det ursprungliga transkriptet inte bara klippt och klistrat, utan dess nukleotidsekvens ändras systematiskt efter transkription. Nukleotidersättningen sker innan translationen påbörjas och medieras av olika guide-RNA och enzymer som skär ut gamla och infogar nya nukleotider på olika sätt för att ge en produkt som inte längre är komplementär till DNA-sträckan från vilken den ursprungligen härleddes, och ett protein som inte längre är co-linjärt med DNA-sekvensen i klassisk molekylärbiologisk mening.klass av mekanismer har visat sig fungera på nivån av RNA-transkript. Det kallas messenger RNA-redigering. I det här fallet - som under tiden har visat sig inte bara vara en exotisk nyfikenhet för vissa trypanosomer - är det ursprungliga transkriptet inte bara klippt och klistrat, utan dess nukleotidsekvens ändras systematiskt efter transkription. Nukleotidersättningen sker innan translationen påbörjas och medieras av olika guide-RNA och enzymer som skär ut gamla och infogar nya nukleotider på olika sätt för att ge en produkt som inte längre är komplementär till DNA-sträckan från vilken den ursprungligen härleddes, och ett protein som inte längre är co-linjärt med DNA-sekvensen i klassisk molekylärbiologisk mening.klass av mekanismer har visat sig fungera på nivån av RNA-transkript. Det kallas messenger RNA-redigering. I det här fallet - som under tiden har visat sig inte bara vara en exotisk nyfikenhet för vissa trypanosomer - är det ursprungliga transkriptet inte bara klippt och klistrat, utan dess nukleotidsekvens ändras systematiskt efter transkription. Nukleotidersättningen sker innan translationen påbörjas och medieras av olika guide-RNA och enzymer som skär ut gamla och infogar nya nukleotider på olika sätt för att ge en produkt som inte längre är komplementär till DNA-sträckan från vilken den ursprungligen härleddes, och ett protein som inte längre är co-linjärt med DNA-sekvensen i klassisk molekylärbiologisk mening. I det här fallet - som under tiden har visat sig inte bara vara en exotisk nyfikenhet för vissa trypanosomer - är det ursprungliga transkriptet inte bara klippt och klistrat, utan dess nukleotidsekvens ändras systematiskt efter transkription. Nukleotidersättningen sker innan translationen påbörjas och medieras av olika guide-RNA och enzymer som skär ut gamla och infogar nya nukleotider på olika sätt för att ge en produkt som inte längre är komplementär till DNA-sträckan från vilken den ursprungligen härleddes, och ett protein som inte längre är co-linjärt med DNA-sekvensen i klassisk molekylärbiologisk mening. I det här fallet - som under tiden har visat sig inte bara vara en exotisk nyfikenhet för vissa trypanosomer - är det ursprungliga transkriptet inte bara klippt och klistrat, utan dess nukleotidsekvens ändras systematiskt efter transkription. Nukleotidersättningen sker innan translationen påbörjas och medieras av olika guide-RNA och enzymer som skär ut gamla och infogar nya nukleotider på olika sätt för att ge en produkt som inte längre är komplementär till DNA-sträckan från vilken den ursprungligen härleddes, och ett protein som inte längre är co-linjärt med DNA-sekvensen i klassisk molekylärbiologisk mening. Nukleotidersättningen sker innan translationen påbörjas och medieras av olika guide-RNA och enzymer som skär ut gamla och infogar nya nukleotider på olika sätt för att ge en produkt som inte längre är komplementär till DNA-sträckan från vilken den ursprungligen härleddes, och ett protein som inte längre är co-linjärt med DNA-sekvensen i klassisk molekylärbiologisk mening. Nukleotidersättningen sker innan translationen påbörjas och medieras av olika guide-RNA och enzymer som skär ut gamla och infogar nya nukleotider på olika sätt för att ge en produkt som inte längre är komplementär till DNA-sträckan från vilken den ursprungligen härleddes, och ett protein som inte längre är co-linjärt med DNA-sekvensen i klassisk molekylärbiologisk mening.

Komplikationerna med den molekylära biologiska genen fortsätter på translationsnivån, dvs syntesen av en polypeptid i enlighet med sekvensen av tripletter i mRNA-molekylen. Det finns fynd såsom translationella startar vid olika startkodoner på en och samma messenger RNA; fall av obligatorisk ramskiftning inom ett givet meddelande utan vilken en icke-funktionell polypeptid skulle resultera; och post-translationell proteinmodifiering såsom avlägsnande av aminosyror från aminoterminalen för den translaterade polypeptiden. Det finns en annan observation som kallas proteinsplitsning, av vilka rapporter har rapporterats sedan början av 1990-talet. Här måste delar av den ursprungliga översättningsprodukten klyvas ut (inteiner) och andra sammanfogas (exteiner) innan de ger ett funktionellt protein. Och slutligen,en ny utveckling från det översatta fältet är att en ribosom kan lyckas översätta två olika messenger-RNA till en enda polypeptid. François Gros, efter ett liv i molekylärbiologi, har kommit till den ganska paradoxalt klingande slutsatsen att med tanke på denna förvirrande komplexitet, den "exploderade genen" le gène éclaté skulle kunna specificeras, om inte alls, endast av "de produkter som härrör från dess aktivitet,”det vill säga de funktionella molekylerna som den ger upphov till (Gros 1991, 297). Men det verkar svårt, om man tänker igenom, att följa Gros råd om en sådan omvänd definition, eftersom fenotypen skulle komma att definiera genotypen.har kommit till den ganska paradoxalt klingande slutsatsen att med tanke på denna förvirrande komplexitet kan den "exploderade genen" le gène éclaté, om alls bara, specificeras av "de produkter som är resultatet av dess aktivitet", det vill säga de funktionella molekylerna som den ger upphov till (Gros 1991, 297). Men det verkar svårt, om man tänker igenom, att följa Gros råd om en sådan omvänd definition, eftersom fenotypen skulle komma att definiera genotypen.har kommit till den ganska paradoxalt klingande slutsatsen att med tanke på denna förvirrande komplexitet kan den "exploderade genen" le gène éclaté, om alls bara, specificeras av "de produkter som är resultatet av dess aktivitet", det vill säga de funktionella molekylerna som den ger upphov till (Gros 1991, 297). Men det verkar svårt, om man tänker igenom, att följa Gros råd om en sådan omvänd definition, eftersom fenotypen skulle komma att definiera genotypen.eftersom fenotypen skulle komma att definiera genotypen.eftersom fenotypen skulle komma att definiera genotypen.

De senaste diskussionerna om genomets struktur och funktion är centrerade kring Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE) -projektet. Projektet syftade till att identifiera alla funktionella element i det mänskliga genomet. Resultaten av konsortiets arbete hittills gör att de redan kända avvikelserna från den klassiska modellen av molekylgenen som ett kontinuerligt proteinkodande område som flankeras av reglerande regioner verkar som regel snarare än undantaget. I stor utsträckning hittade ENCODE-forskare överlappning av transkript, produkter härrörande från vidsträckta separerade DNA-sekvensdelar och spridda reglerande sekvenser för en given gen. Resultaten bekräftar också att de flesta av genomet transkriberas och betonar vikten och genomgången hos funktionella icke-proteinkodande RNA-transkript som har dykt upp under det senaste decenniet vilket tyder på ett "enormt doldt lager av RNA-regulatoriska transaktioner" (Mattick 2007). Mot bakgrund av dessa fynd har en definition av genen föreslagits, enligt vilken "Genen är en sammanslutning av genomiska sekvenser som kodar en sammanhängande uppsättning potentiellt överlappande funktionella produkter." (Gerstein et al. 2007, 677). Sådana definitioner tjänar främst syftet med att lösa annoteringsproblemet (Baetu 2012), som blir särskilt viktigt i samband med den ökande betydelsen av bioinformatik och användningen av databaser som kräver en konsekvent ontologi (Leonelli 2008). Mer kontroversiell är begreppet funktion som är involverad här. Enligt ENCODE Consortium gjorde deras data dem möjlig "att tilldela biokemiska funktioner för 80% av genomet." (ENCODE Project Consortium 2012, 57), trots att enligt konservativa uppskattningar endast 3–8% av baserna är under reningsval, vilket vanligtvis tas för att indikera sekvensfunktion. Kritiker har hävdat att ett etiologiskt begrepp om funktion, enligt vilken funktion är en utvald effekt, är mer lämpligt i samband med funktionell genomik (Doolittle et al. 2014), medan andra hävdar att varje kausal roll för en DNA-sträng kan vara relevant, särskilt i biomedicinsk forskning (se Germain et al. 2014 för en filosofisk insats i diskussionen). Som vi har märkt för tidigare vändningar i genkonceptets historia har denna utveckling drivits av tekniska framsteg,särskilt vid djup RNA-sekvensering och i identifiering av protein-DNA-interaktioner.

Sammanfattningsvis kan det sägas med Falk (2000, 327) att å ena sidan den autokatalytiska egenskapen som en gång tillskrivits genen som en elementär enhet har förflyttats till DNA i stort. Replikation kan inte längre anses vara specifik för genen som sådan. När allt kommer omkring är DNA-replikationsprocessen inte punkterad av gränserna för kodande regioner. Å andra sidan, som många observatörer av scenen har påpekat (Kitcher 1982; Gros 1991; Morange 2001; Portin 1993; Fogle 2000), har det blivit allt svårare att definiera tydliga egenskaper hos en gen som en funktionell enhet med heterokatalytisk egenskaper. Det har blivit en fråga om val under kontekstuella begränsningar för vilka sekvenselement som ska inkluderas och vilka som ska uteslutas i funktionens karakterisering av en gen. En del har därför antagit en pluralistisk inställning till genbegrepp. (Burian 2004).

Det har varit olika reaktioner på denna situation. Forskare som Thomas Fogle och Michel Morange medger att det inte längre finns en exakt definition av vad som kan räkna som en gen. Men de oroar sig inte så mycket för den här situationen och är redo att fortsätta att prata om gener på ett pluralistiskt, kontextuellt och pragmatiskt sätt (Fogle 1990, 2000; Morange 2000b). Elof Carlson och Petter Portin har också kommit fram till att det nuvarande genbegreppet är abstrakt, allmänt och öppet, trots eller bara för att nuvarande kunskap om det genetiska materialets struktur och organisation har blivit så omfattande och så detaljerad. Men de, som Richard Burian (1985), tar öppna koncept med en stor referenspotential, inte bara som ett underskott att leva med, utan som ett potentiellt produktivt verktyg inom vetenskapen. Sådana koncept erbjuder alternativ och lämnar val öppet (Carlson 1991, Portin 1993). Filosofen Philip Kitcher berömde, som en följd av all molekylär inmatning av genen, redan för 25 år sedan genens "heterogena referenspotential" som en dygd och drog den ultraliberala slutsatsen att "det inte finns någon molekylär biologi för genen. Det finns endast molekylärbiologi av det genetiska materialet”(Kitcher 1982, 357).

Från perspektivet av den autokatalytiska och evolutionära dimensionen av det genetiska materialet har den reproduktiva funktionen som tillskrivs gener visat sig vara en funktion av hela genomet. Replikeringsprocessen, det vill säga transmissionsaspekten av genetik som sådan har visat sig vara en komplicerad molekylär process vars mångsidighet, långt ifrån begränsad till genblandning under meiotisk rekombination, utgör en reservoar för evolution och drivs av en mycket komplex molekyl maskiner inklusive polymeraser, gyraser, DNA-bindande proteiner, reparationsmekanismer och mer. Genomiska skillnader, inriktade på selektion, kan då, men får inte bli "indelade i gener" under evolutionen, som Peter Beurton har uttryckt det (Beurton 2000, 303).

Å andra sidan finns det de som tar genens heterokatalytiska variabilitet som ett argument för att behandla det genetiska materialet som helhet, därmed gener också, inte längre så grundläggande i sig, utan som en utvecklingsresurs som behöver att kontextualiseras. De hävdar att tiden har kommit, om inte att lösa upp, för att åtminstone bädda in genetik i utveckling och till och med utveckling i reproduktion - som James Griesemer antyder (Griesemer 2000) - och därmed ta upp tråden där Kühn och andra lämnade den mer än för ett halvt sekel sedan. Följaktligen definierar Moss "Gen-D" (motsvarigheten till den tidigare nämnda fenotypiskt definierade Gen-P) som en "utvecklingsresurs (därav D), som i sig är obestämd med avseende på fenotyp. Att vara en gen-D är att vara en transkriptionell enhet på en kromosom,inom vilka innehåller molekylära mallresurser”(Moss 2003, 46; jfr. Moss 2008). Enligt denna bild utgör dessa mallar endast en reservoar som utvecklingsprocessen bygger på och inte är ontologiskt privilegierade som ärftliga molekyler.

Med molekylärbiologi "gick den klassiska genen" molekylär "(Waters 1994). Ironiskt nog löstes den ursprungliga idén om gener som enkla DNA-streck som kodar för ett protein i denna process. Så fort genen från klassisk genetik hade förvärvat materialstruktur genom molekylärbiologi, sprickades de biokemiska och fysiologiska mekanismerna som stod för dess överföring och uttryck. Utvecklingen av själva molekylärbiologin - det företaget som så ofta beskrivs som en fullständigt reduktionistisk erövring - har gjort det omöjligt att tänka på genomet helt enkelt som en uppsättning bitar av sammanhängande DNA som är linjära med de proteiner som härrör från det. I början av det tjugoförsta århundradet, när resultaten av Human Genome Project presenterades i tid vid femtioårsdagen av den dubbla helixen,molekylärgenetik verkar ha åstadkommit en full cirkel, lästressande reproduktion och arv inte längre från ett rent genetiskt, utan ur ett evolutionärt-utvecklingsperspektiv. Samtidigt har genen blivit en central kategori inom medicin under 1900-talets lopp (Lindee 2005) och dominerar diskurser om hälsa och sjukdomar i den postgenomiska eran (Rose 2007).

4. Genen i evolution och utveckling

En av de mer spektakulära händelserna i biologin från det tjugonde århundradet som en disciplin, utlöst av genetikens ökning (särskilt matematisk befolkningsgenetik), var den så kallade "moderna evolutionära syntesen." I en hel serie läroböcker, publicerade av evolutionsbiologer som Theodosius Dobzhansky, Ernst Mayr och Julian S. Huxley, användes resultaten av befolkningsgenetik för att återupprätta den darwinistiska, selektivistiska evolutionen. Efter”förmörkelsen av darwinismen”, som hade regerat omkring 1900 (Bowler 1983), gav neo-darwinismen återigen en förenande, förklarande ram för biologi som också inkluderade de mer beskrivande, naturalistiska discipliner som systematik, biogeografi och paleontologi (Provine 1971; Mayr & Provine 1980; Smocoovitis 1996).

Scott Gilbert (2000) har tagit fram sex aspekter av begreppet gen som den hade använts i populationsgenetik fram till den moderna evolutionära syntesen. Först var det en abstraktion, en enhet som var tvungen att uppfylla formella krav, men som inte behövde anges och faktiskt inte var materiellt specificerad. För det andra, den evolutionära genen var tvungen att resultera i eller måste korreleras med någon fenotypisk skillnad som kunde "ses" eller målsättas genom selektion. För det tredje, och på samma sätt, var genen för den evolutionära syntesen den enhet som i slutändan var ansvarig för att selektion skulle inträffa och pågå i generationer. För det fjärde jämställdes genen för den evolutionära syntesen till stor del med vad molekylärbiologer kallade "strukturella gener." För det femte var det en gen uttryckt i en organisme som konkurrerade om reproduktiv fördel. Och slutligen,det sågs som en i stort sett oberoende enhet. Richard Dawkins har tagit detta sista argument till sin yttersta genom att definiera genen som en "självisk" replikator med ett eget liv, tävla med sina medgener och använda organismen som ett instrument för sin egen överlevnad (Dawkins 1976; jfr. Sterelny och Kitcher 1988).

Molekylärbiologi, där högre organismer rör sig i centrum under de senaste tre decennierna, har gjort en karikatyr av denna typ av evolutionär gen, och har rört sig för våra ögon gener och hela genom som komplexa system som inte bara möjliggör för evolution att ske, utan att vara själva utsattes för en kraftfull utvecklingsprocess. Genomet har i sin helhet fått en mer och mer flexibel och dynamisk konfiguration. Evelyn Fox Keller talar om “reaktiva genomer” (Keller 2014). Inte bara har de mobila genetiska elementen, som kännetecknas av McClintock för mer än ett halvt sekel sedan i Zea mays, vunnit valuta i form av transposoner som regelbundet och oregelbundet kan skäras ut och sätts över hela bakteriella och eukaryota genom, det finns också andra former av blandning som uppstår på DNA-nivå. En gigantisk mängd somatisk geninkling och DNA-skarvning, till exempel, är involverad i att organisera immunsvaret. Det ger upphov till produktion av miljontals olika antikroppar. Inget genom skulle vara tillräckligt stort för att klara en sådan uppgift om inte parcelleringen av gener och en sofistikerad permutation av deras delar inte hade uppfunnits under evolutionen. Genfamiljer har uppstått genom duplicering över tid och innehåller tystade gener (ibland kallade pseudogener). Gener verkar ha till stor del härrört från moduler genom kombination. Vi hittar hoppande gener och flera gener av en sort som kodar för olika proteinisoformer. Kort sagt verkar det finnas ett helt batteri av mekanismer och enheter som utgör det som har kallats”ärftlig andning” (Gros 1991, 337).är involverad i att organisera immunresponsen. Det ger upphov till produktion av miljontals olika antikroppar. Inget genom skulle vara tillräckligt stort för att klara en sådan uppgift om inte parcelleringen av gener och en sofistikerad permutation av deras delar inte hade uppfunnits under evolutionen. Genfamiljer har uppstått genom duplicering över tid och innehåller tystade gener (ibland kallade pseudogener). Gener verkar ha till stor del härrört från moduler genom kombination. Vi hittar hoppande gener och flera gener av en sort som kodar för olika proteinisoformer. Kort sagt verkar det finnas ett helt batteri av mekanismer och enheter som utgör det som har kallats”ärftlig andning” (Gros 1991, 337).är involverad i att organisera immunresponsen. Det ger upphov till produktion av miljontals olika antikroppar. Inget genom skulle vara tillräckligt stort för att klara en sådan uppgift om inte parcelleringen av gener och en sofistikerad permutation av deras delar inte hade uppfunnits under evolutionen. Genfamiljer har uppstått genom duplicering över tid och innehåller tystade gener (ibland kallade pseudogener). Gener verkar ha till stor del härrört från moduler genom kombination. Vi hittar hoppande gener och flera gener av en sort som kodar för olika proteinisoformer. Kort sagt verkar det finnas ett helt batteri av mekanismer och enheter som utgör det som har kallats”ärftlig andning” (Gros 1991, 337). Inget genom skulle vara tillräckligt stort för att klara en sådan uppgift om inte parcelleringen av gener och en sofistikerad permutation av deras delar inte hade uppfunnits under evolutionen. Genfamiljer har uppstått genom duplicering över tid och innehåller tystade gener (ibland kallade pseudogener). Gener verkar ha till stor del härrört från moduler genom kombination. Vi hittar hoppande gener och flera gener av en sort som kodar för olika proteinisoformer. Kort sagt verkar det finnas ett helt batteri av mekanismer och enheter som utgör det som har kallats”ärftlig andning” (Gros 1991, 337). Inget genom skulle vara tillräckligt stort för att klara en sådan uppgift om inte parcelleringen av gener och en sofistikerad permutation av deras delar inte hade uppfunnits under evolutionen. Genfamiljer har uppstått genom duplicering över tid och innehåller tystade gener (ibland kallade pseudogener). Gener verkar ha till stor del härrört från moduler genom kombination. Vi hittar hoppande gener och flera gener av en sort som kodar för olika proteinisoformer. Kort sagt verkar det finnas ett helt batteri av mekanismer och enheter som utgör det som har kallats”ärftlig andning” (Gros 1991, 337).som innehåller tystade gener (ibland kallade pseudogener). Gener verkar ha till stor del härrört från moduler genom kombination. Vi hittar hoppande gener och flera gener av en sort som kodar för olika proteinisoformer. Kort sagt verkar det finnas ett helt batteri av mekanismer och enheter som utgör det som har kallats”ärftlig andning” (Gros 1991, 337).som innehåller tystade gener (ibland kallade pseudogener). Gener verkar ha till stor del härrört från moduler genom kombination. Vi hittar hoppande gener och flera gener av en sort som kodar för olika proteinisoformer. Kort sagt verkar det finnas ett helt batteri av mekanismer och enheter som utgör det som har kallats”ärftlig andning” (Gros 1991, 337).

Molekylära evolutionsbiologer har knappt skrapat ytan och knappt börjat förstå denna flexibla genetiska apparatur, även om Jacob redan framförde en bild av genomet som en dynamisk kropp av förestående itererade och tippade bitar för mer än trettio år sedan (Jacob 1977). Genomsekvensering i kombination med intelligent sekvensdatajämförelse tar för närvarande ut mer och mer av denna struktur (om utvecklingen historia, se García-Sancho 2012, om>

sep man ikon
sep man ikon

Hur man citerar det här inlägget.

sep man ikon
sep man ikon

Förhandsgranska PDF-versionen av denna post på Friends från SEP Society.

ino-ikon
ino-ikon

Slå upp det här ämnet vid Internet Philosophy Ontology Project (InPhO).

phil papper ikon
phil papper ikon

Förbättrad bibliografi för detta inlägg på PhilPapers, med länkar till dess databas.

Andra internetresurser

  • MendelWeb, underhållen av Roger B. Blumberg
  • Elektroniskt vetenskapligt publicering, underhållet av Robert J. Robbins
  • Representant Genes Project, underhållet av Paul Griffiths (U. Sydney) och Karola Stotz (U. Sydney)
  • Virtual Laboratory, Max Planck Institute for Science of Science, Berlin